卡卡西的组缺少人手,于是宇智波鼬便加入了卡卡西所在的一组,起初年纪比较小的鼬不被他人留意,反而招来了冷嘲热讽,但不久之后鼬的能力展现了出来令所有人惊奇并由衷的佩服,直到宇智波叛乱鼬出走木叶结束。卡卡西说过鼬加入了这么长时间自己却对他还是一无所知。由于迈特凯等人在和卡卡西一同执行任务时亲眼目睹了卡卡西冷血的眼神,便连同同期忍者请求三代火影解放卡卡西让其成为担当上忍收徒,希望通过收徒改变卡卡西心中的黑暗,第三代火影同意了这个请求。在成为担当上忍以后卡卡西立志不允许让不懂得珍惜同伴的人成为忍者,果然他所在的组通过率为0,卡卡西也在扪心自问如果当时波风水门发现自己根本没有团队意识的话会如何。同时怀疑自己的要求是不是太苛刻了。第三代火影跟卡卡西谈话,再一次消除了卡卡西心中的疑虑,而曾经教过的学生们并没有恨他反而很感谢他当初的做法,更加坚定了卡卡西的信念。第三代火影打算让卡卡西负责新毕业的三个学生:漩涡鸣人、宇智波佐助、春野樱。鸣人等人刚从学院毕业后,卡卡西就成为鸣人、佐助及小樱这些下忍的带队老师,但是卡卡西再为他们这些毕业生安排生存测试,若不能通过就要求他们重返学院学习。历年来均没有人成功通过卡卡西的下忍测试,卡卡西的下忍测试,是要求鸣人他们在中午前,夺去绑在自己腰间的两个铃,由于只有两个,故此队中最多只有两人能成功通过考试,一人则被淘汰,被淘汰者非但没有饭吃,更可能被评为不合格而重返学院。卡卡西亦要他们以抱着杀死他的心,才有机会夺去他手上的铃。三人当中,鸣人的表现最差,他非但不隐藏起来,还大模大样地向他挑战,结果被卡卡西以体术秘技——“千年杀”击飞。之后又中了卡卡西设的简单陷阱,两次被吊在树上,被卡卡西批评为“只会横冲直撞,破绽百出”。相反,樱及佐助比较冷静,他们一开始就隐藏起来。佐助趁卡卡西向吊在树上的鸣人讲解时,掷出手里剑攻击他,但却只打中他的替身。后来再度遇上卡卡西,其身手及智谋,以及使出火遁·豪火球之术,令卡卡西不得不承认其天赋。但最后仍被卡卡西以忍术土遁术·御杀斩首术埋在地下。卡卡西批评佐助只喜欢个人主义,不明白队伍合作的重要性。至于樱,一如以往只担心佐助。所以当佐助的偷袭失败后,就去找佐助。途中却中了卡卡西的幻术,身受重伤的佐助向他求救,她立刻被吓得晕倒。醒来后,误以为佐助真的有生命危险,故继续找佐助。但当看见被埋在地上,头部外露的佐助跟他说话时,便以为是死去的佐助在和她说话,二话不说再次晕倒。结果,三人都不能在中午时份抢到卡卡西的两个铃,鸣人更因欲偷走测试中准备的食物,被卡卡西缚在木柱上。卡卡西说他们三人跟本没资格当忍者,连返回学院的资格也没有。卡卡西也说出测试的真正目的,就是要他们表现“团队合作”的重要性,即使面对自己可能要被淘汰出局,也能放弃个人利益,跟伙伴一起合作;那些只顾自己表现及不重视队友的人,是不能做忍者的,之后又向他们展示了旁边石碑上殉职的英雄。后来卡卡西“手下留情”,说又再给他们一次机会,但却不准许樱及佐助给鸣人食物。就在卡卡西离开后,佐助深明卡卡西真正的意思,私下给鸣人食物;樱看见后,也把自己的一份给鸣人吃。卡卡西突然出现,告诉他们已经过关,因为他们不像以往考生那样,没有自己的想法,亦没有重视伙伴的精神。卡卡西和鸣人等人接受了C级任务,要护送建筑工人达兹纳回国,但途中遇上被波之国无良商人卡多雇佣的叛忍桃地再不斩和白,卡卡西两次与再不斩交手。第一次,卡卡西中了再不斩的计谋,被水牢之术困住,幸好鸣人及时相救。之后卡卡西使用写轮眼,复制再不斩的水遁·水龙弹之术,将其击败,但也因为查克拉消耗过大休养了一段时间。第二次,卡卡西使出追牙术,困住再不斩,然后使用雷切,但这一招却被白拼死挡住,见白已死,心灰意冷的再不斩牺牲了自己的性命,反过来把作恶多端的卡多杀死。根据他临终前的托付,卡卡西把再不斩、白连同再不斩的斩首大刀葬在一起。在中忍考试中,卡卡西一直在旁边观看鸣人等三个学生的比赛。当佐助在第一战胜出后,卡卡西就把大蛇丸留在佐助脖子的天之咒印暂时封印。然而却遇上了传说中“三忍”之一——大蛇丸,企图带走佐助,卡卡西便向大蛇丸展示自创秘技--雷切及开启写轮眼,还警告大蛇丸如欲带走佐助,决定与他同归于尽。不过大蛇丸就暗示卡卡西根本没有这种能力杀死他,但亦没有立刻带走佐助,转眼便离开了。卡卡西亦意识到自己没有杀死大蛇丸的能力。后来卡卡西在第三场正式考试前,努力训练跟他有相同“雷”属性的佐助。卡卡西对佐助进行了多日刻苦的训练后,终于让佐助完成可克制我爱罗“砂防御”的“千鸟”;并在佐助比赛资格快要被取消的那一刻,及时把佐助送到中忍考试会场内。然而,就在佐助跟我爱罗进行激战之际,大蛇丸突然对木叶隐村发动了攻击,而佐助亦追赶被千鸟打伤的我爱罗。另一方面,卡卡西则解开了音忍药师兜对会场观众释放的幻术,他命令春野樱把中了幻术的漩涡鸣人及奈良鹿丸唤醒,并跟忍犬帕克一起、前往阻止佐助追击我爱罗。大蛇丸更联同砂忍合力进攻木叶村,我爱罗的任务之一就是在大蛇丸进攻的同时发动一尾,可惜由于他的情绪波动在中忍考试时已经提前发动了一尾,但被佐助的千鸟打伤后被手鞠和勘九郎带走,之后他安定下来再次发动一尾,佐助赶上跟我爱罗大战,可惜佐助始终不敌一尾,一尾正想杀佐助之时鸣人及时赶到救下佐助,更发动前所未见的力量最后和我爱罗打得两败俱伤。卡卡西则联同阿凯,应付密集如云的音忍及砂忍。结果大蛇丸计划失败,但三代火影亦付出了自己的生命。就在第三代火影的丧礼进行前,卡卡西自己一人前往英雄慰灵碑处,悼念过去死去的队友——宇智波带土。就在木叶崩溃战后不久、百废待兴时,两名隶属于神秘组织——“晓”的S级叛忍来到了木叶村。其中一人就是佐助的哥哥宇智波鼬,另外一人是前“忍刀七人众”之一的干柿鬼鲛。他们前来木叶的目的,就是为了逮捕“九尾人柱力”——漩涡鸣人。中途却遇上了两名正在巡逻的上忍——猿飞阿斯玛及夕日红,并打了起来。但鼬及鬼鲛的实力实在太强,阿斯玛跟红不久就败下阵来。此时,卡卡西刚好赶到,复制鬼鲛的水鲛弹之术,并把鬼鲛逼退。他质问鼬回来的目的,瞬间又跟鼬进行激战,仅仅只是短暂的交手,鼬便将卡卡西、阿斯玛和红逼入劣势,同时卡卡西为了保护其他两人以及写轮眼的副作用而有些疲惫。他深知鼬写轮眼幻术的厉害,所以劝阿斯玛及红闭上眼睛,以免中了幻术。卡卡西认为只有自己的写轮眼才能对付写轮眼,但谁不知鼬的写轮眼是进化了的万花筒写轮眼,实力差距太大;再加上卡卡西没有宇智波一族的血统,不能熟练运用写轮眼,用了不久体力便应付不了。因此,鼬只使出了一招幻术--月读,就令卡卡西的精神崩溃,像是快要被鼬千刀万剐似的,没办法继续作战。由于鼬知道卡卡西认识“晓”,所以便决定要把他带走,并让鬼鲛攻击阿斯玛及红。幸亏好友迈特凯及时赶到,把鬼鲛踢开,成功救出卡卡西、阿斯玛及红。鼬知道阿凯不是个简单的人物,不欲多战,便跟鬼鲛离去。而卡卡西则需到医院接受治疗,直到纲手把他救醒为止。自佐助执行任务以来,多次需要鸣人的协助才能逃过危机,于是佐助开始对鸣人的能力感到嫉妒。卡卡西对此是非常清楚的,于是当佐助跟鸣人在医院天台对战时,他及时阻止二人的战斗,并化解了他们的螺旋丸及千鸟攻击。之后佐助独自在树上沉思时,卡卡西便试图开解他,认为失去亲人固然悲痛,但卡卡西自己也曾尝过这种滋味;卡卡西说:“现在你已经有鸣人这些朋友了,应放下复仇之事。”之后音忍四人众来找寻佐助更向他攻击,临走的时候跟佐助说如果想得到力量就来找大蛇丸,此话一直被佐助记住。卡卡西的一番话并未真正令佐助茅塞顿开。为了追寻强大的力量,佐助决定跟随音忍四人众叛离木叶隐村。鹿丸四人小队出发,鸣人和佐助苦战也没有成功将他带回,佐助开启了咒印的力量击倒鸣人后离开。纲手向卡卡西下达了S级任务,但是被卡卡西拒绝并表示这次是认真的。卡卡西赶到终结之谷时,佐助跟鸣人的决斗已结束,只剩下鸣人倒在地上;他唯有把鸣人先带回村里医治,再做下一步打算。晓组织捉去了拥有一尾力量的人柱力第五代风影我爱罗。砂忍向木叶求援,木叶派出卡卡西班,砂隐的千代婆婆其后一同加入。第五代火影纲手再派出凯班作增援,两班分别在途中遇上‘晓’的成员宇智波鼬和鬼鲛。后来与鸣人合作,及鸣人使出螺旋丸加强版--大玉螺旋丸,将宇智波鼬的替身击败。之后再遇上“晓”的成员迪达拉及赤砂之蝎,迪达拉以我爱罗的尸体把性格冲动的鸣人引开。为了避免鸣人独自行动,他从后面追赶鸣人,留下樱及千代婆婆暂时应付蝎。为了节省时间,卡卡西开启了万花筒写轮眼使用神威。但是此时卡卡西对他新的写轮眼还不熟悉,还不能熟练的控制结界空间的位置和大小,瞳术打偏到了迪达拉的右手上,而且卡卡西在体力方面亦明显不能支撑这种术,很快就感到疲惫。掉下巨鸟的迪达拉变出分身,欲把他们全部炸死,卡卡西又用神威把他和爆炸一起转移到了另一个空间。由于连续使用两次万花筒写轮眼,卡卡西需要休息一段时间。期间由来自暗部的天藏暂代七班的队长。猿飞阿斯玛在对决晓不死组合飞段、角都时牺牲,第十班矢志为老师复仇。卡卡西主动请缨,暂作为第十班的队长,去寻找飞段、角都。甫一对战,卡卡西便用写轮眼看出了角都的土属性结印并以雷切破了其土遁硬化术并刺穿其心脏。谁知对方拥有多个从其他忍者抢来的心脏所以没有死。并且角都能使用心脏所属属性的忍术。后飞段去攻击卡卡西,角都在后面攻击,企图利用飞段的不死之身将卡卡西消灭,所幸被卡卡西及时躲开。后卡卡西发动双手雷切替第十班成员挡去了角都的伪暗。这时候局面以一敌二,非常不利……连续的消耗使卡卡西喘不过气来;不过,最令卡卡西惊讶的,就是角都居然曾经跟初代火影对战过。这时角都欲以卡卡西的心脏填补被雷切摧毁的心脏。面对角都的风火遁攻击,卡卡西用水阵壁抵挡,但风火克水;趁卡卡西不注意,角都用“地怨虞”将他绑住,准备强行用血管挖出卡卡西的心脏。然而,卡卡西在之前就取得了角都的血液并把它交给鹿丸,飞段被鹿丸所骗误用角都的血液使用咒术,角都心脏被破倒地。但角都却突然将全身的触手伸出,把卡卡西他们绑着,情况不利。卡卡西欲使出万花筒写轮眼,这时大和,鸣人等赶到,最后角都被鸣人的风遁螺旋手里剑击倒。而卡卡西以雷切击败倒在地上、动弹不得的角都,摧毁他最后一个心脏,后把角都的尸体带回木叶村给纲手研究。